Kisame pada akhirnya menjadi ninja pelarian, ketika negara air mencarinya, karena merencanakan menggulingkan pemerintahannya dan terlibat dalam berbagai pembunuhan.
Termasuk Daimyo dari negara lain, dengan kepergiannya dia membawa Samehada bersamanya, menyebabkan Kirigakure kehilangan salah satu dari 7 pedangnya.
Kisame pada akhirnya menjadi ninja pelarian, ketika negara air mencarinya, karena merencanakan menggulingkan pemerintahannya dan terlibat dalam berbagai pembunuhan.
Termasuk Daimyo dari negara lain, dengan kepergiannya dia membawa Samehada bersamanya, menyebabkan Kirigakure kehilangan salah satu dari 7 pedangnya.
Kisame pada akhirnya bergabung dengan Akatsuki dan karena sejarahnya membunuh orang-orang yang dekat dengannya, serta pengkhianat, dia bermitra dengan Itachi untuk mengawasinya.
Meskipun pada awalnya Itachi dan Kisame saling menyapa dengan permusuhan, mereka pada akhirnya menjadi mitra yang sangatlah baik.
Akatsuki kemudian mencari anggota baru, mendekati Deidara untuk bergabung dengan organisasi mereka.
Setelah terperangkap dalam genjutsu Itachi, Kisame menertawakan Deidara, karena kelemahannya saat melawan Itachi.
Setelah pertarungan berakhir Kisame, Itachi dan Sasori berhasil merekrut Deidara untuk bergabung dengan Akatsuki.
Beberapa tahun kemudian, atas perintah pemimpin Akatsuki, yaitu Pain, mereka pergi ke Desa Konoha untuk ditugaskan menangkap Naruto Uzumaki yang merupakan Jinchuriki dari ekor 9.